盐城工学院人武部（与保卫部合署）是学校党委军事工作的职能部门，正处级建制。主要负责学校军事课程建设，组织开展学生军事技能训练，指导军事教研室开展军事理论教学等国防教育活动；协调落实双拥工作，开展拥军优属、军地共建等活动；开展学生兵员征集工作，完成兵役机关交办的征兵任务；完成国防潜力调查与民兵训练任务、预备役登记和报告工作；负责落实平时国防动员准备工作，在国家发布动员令后，完成规定的动员任务。人武部下设军事教研室。

盐城工学院保卫部、安全保卫处是在学校党委、行政的领导和上级公安机关业务指导下，开展学校安全保卫工作的职能部门，正处级建制。以为教学、科研和服务师生为中心；以治安防范为重点；以确保学校安全稳定为目标。坚持“以防为主、打防结合”和“专群结合、群防群治”的工作方针，积极开展校园安全保卫工作，预防控制和减少校园违法犯罪活动和安全事故的发生。安全保卫处下设保卫科、综合科、安全管理科和治安管理科。现有在编职工25人，外聘保安及劳务用工41人。

2021年学校岗位机构设置调整时，将原保卫处更名为安全保卫处。

人武部机构设置：

部  长：张晓东

副部长：林沛峰

副部调研员：张雨青

军事教研室主任：薛俊义

保卫部、安全保卫处机构设置：

部（处）长：张晓东

副部（处）长：林沛峰

副部（处）调研员：张雨青

综合科科长：陈卫嵘

治安管理科科长：俞曙阳

安全管理科副科长：宋兆群

保卫科科长：周永明

保卫科副科长：王晶晶